全自動固相萃取儀能自動完成固相萃取全過程：柱活化-上樣-柱淋洗-柱干燥-柱洗脫的步驟，還有自動完成柱切換等功能，并且可以實現批量樣品的處理。而普通的固相萃取裝置需要實驗人員手工操作，這會產生很多差異性的問題，比如：
1、安全性的差異。固相萃取過程中會用到各種各樣的化學試劑、容積等，其中難免會有一定的危險性，所以全自動固相萃取儀在安全性方面還是更好一些。
2、數據誤差的差異性。人無完人，人工操作時不可避免的會出現一些小失誤、小疏忽，這些都會大大影響zui終的實驗數據。而機器雖然冰冷，但是它會按照設定好的程序來運行，不會出現小失誤的情況。
3、實驗效率的差異性。毫無疑問，全自動設備的效率肯定遠遠高過人工。此外，一定程度下，設備可以24小時運行，樣品處理能力大大提升。
4、成本的差異性。全自動固相萃取儀的成本主要是設備本身的成本，人工的主要成本也就是人工。另外試劑的消耗方面，人工會略高于設備，可以忽略不計。
總體而言，使用全自動固相萃取儀的初期成本可能會略高，但是收益也是非常高的。首先是樣品處理效率會提高很多，如果實驗室需要處理的樣品數量較大的話，就非常適合用全自動設備。還有一個不可忽視的優點就是實驗的誤差更小了，減小誤差所帶來的價值不好判斷，但應該是值得的。
建議有能力的實驗室可以體驗一下，會給你帶來意想不到的好處。